بحران بین بغداد و اربیل بیش از بیست سال است که ادامه دارد، هرچند شدت اختلافات بسته به پویایی درگیری‌های داخلی، منطقه‌ای و بین‌المللی متغیر است. این بحران عمدتاً از دو موضوع ناشی می‌شود: نخست، اختلافات مالی، شامل سرمایه‌گذاری‌های نفتی و سهم اقلیم از بودجه فدرال؛ دوم، مناطق مورد مناقشه، به‌ویژه استان کرکوک که در خط مقدم قرار دارد. این مسئله تاکنون حل‌نشده باقی مانده و خط قرمزی برای طرفین محسوب می‌شود.